杏仁核（英语：Amygdala，拉丁形式 ἀμγδαλή）又名杏仁体，位于侧脑室下角前端的上方，海马体旁回沟的外侧，顶部与与尾状核的末端相连。
杏仁核是边缘系统的皮质下中枢，有调节内脏活动和产生情绪的功能。引发应急反应，让动物能够挺身而战或是逃离危险。